Pro cvičení využívaný ImageJ je veřejně dostupný program (National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA) pro zpracování a analýzu obrazu, založený na programovacím jazyku JAVA. Je proto možné jej používat na různých operačních systémech (Win, Mac, Linux). Jedná o otevřený systém, do kterého je možné implemetovat různé další uživatelsky vytvořené moduly - pluginy. Ty jsou zpravidla opět volně dostupné dalším uživatelům a představují tak širokou základnu nástrojů pro různé aplikace.
