| Umlčování exprese transgenů u rostlin |
 Typ práce |
diplomová |
| Školitel |
RNDr. Lukáš Fischer, Ph.D.
Katedra fyziologie rostlin PřF UK
kontakt: lukasf@natur.cuni.cz
tel: 22 195 1688 |
Anotace:
Vnesení transgenu do rostlinné buňky a ověření jeho integrace do genomu není zárukou jeho stabilní exprese. Na úrovni jednotlivých buněk totiž mnohdy dochází k rozpoznávání transkriptů vnesených genů (jejich degradačních produktů) a vyvolání obranné reakce – RNA interference (silencingu) - vedoucího k cílené degradaci mRNA daného genu (popř. až zastavení transkripce genu v důsledku metylace DNA a změny struktury chromatinu). Tento mechanismus umlčování genové exprese (tzv. silencing) je rostlinami využíván (a možná i původně vytvořen) na ochranu proti virové infekci. Proto se informace o nutnosti umlčet expresi příslušných genů ve formě siRNA šíří mezi sousedními buňkami i prostřednictvím floémového toku na úrovni celé rostliny.
Diplomová práce naváže na aktuální výsledky týmu v některé z těchto problematik – studium stability exprese transgenů, jejich samovolného či indukovaného umlčování, reaktivace jejich exprese a analýz methylačního stavu DNA. Modelové organismy: lilek brambor, tabáková buněčná linie BY-2. Metodiky: isolace a analýzy nukleových kyselin (PCR, hybridizace), hydrogensiřičitanové sekvenování, fluorescenční mikroskopie (detekce GFP), přípravy genových konstruktů a transformace rostlinných buněk (příprava a analýzy transgenních rostlin), …
|
|
