Izotypové složení aktinu v rostlinné buňce a jeho význam
 Typ práce bakalářská - literární rešerše
 Školitel RNDr. Kateřina Schwarzerová, Ph.D.
Katedra fyziologie rostlin PřF UK, Viničná 5, Praha 2
kontakt: schwarze@natur.cuni.cz
tel: 22 195 1688
web: http://kfrserver.natur.cuni.cz/vyzkum/tymy/tym_opat/cytoskelet/index.htm
 Konzultant Mgr. Lukáš Fischer, Ph.D.
Katedra fyziologie rostlin PřF UK, Viničná 5, Praha 2
kontakt: lukasf@natur.cuni.cz
tel: 22195 1688
web: http://kfrserver.natur.cuni.cz/vyzkum/tymy/tym_opat/molbio/index.htm
 Náplň práce:

Cytoskelet představuje jednu z nejdůležitějších struktur eukaryotické buňky. Tyto proteinové vláknité struktury vznikají polymerací proteinových monomerů tubulinu (v případě mikrotubulů) a aktinu (v případě aktinových filament). Cytoskelet vykonává v živočišných i rostlinných buňkách množství funkcí. Tato mnohočetnost rolí je umožněna dynamikou cytoskeletu i jeho složením. Na funkcích cytoskeletu mají podstatný podíl například asociované proteiny, které regulují dynamiku cytoskeletálních polymerů, interakce mezi cytoskeletálními polymery (svazkování, zesíťování), či jejich interakce s okolními strukturami (organelami, proteinovými komplexy, membránami). Významnou roli ve vlastnostech výsledného cytoskeletálního polymeru však má i složení na úrovni monomerů. Aktiny i tubuliny jsou kódovány genovými rodinami, proto je v buňce syntetizováno vždy několik druhů aktinových a tubulinových monomerů – izotypů. Jednotlivé monomery jsou navíc dále posttranslačně upravovány, což je zdrojem další heterogenity monomerních podjednotek. V různých částech rostliny je pravděpodobně syntetizována vždy jen určitá skupina izotypů. Například aktiny rostliny Arabidopsis thaliana lze rozdělit do dvou skupin podle toho, zda jsou syntetizovány v generativních či vegetativních pletivech.

Cílem bakalářské práce je zpracovat formou literárního přehledu současný stav poznání o roli izotypového složení rostlinného aktinového cytoskeletu v životě rostliny. Přehled by měl zahrnout údaje o molekulární podstatě rozdílů mezi izotypy aktinu (rozdíly mezi geny genových rodin, informace o posttranslační modifikaci aktinů), poznatky o jejich expresi v rostlinné buňce, případně o regulaci exprese jednotlivých genů. Dále by měla být pozornost věnována informacím o roli rozdílných izotypů aktinu v různých rostlinných pletivech. Součástí literární rešerše by měl být též základní přehled o metodách, využívaných ke studiu aktinového cytoskeletu a jeho izotypového složení.

Na bakalářskou práci je možné navázat diplomovou prací „Role cytoskeletu v průběhu somatické embryogeneze smrku“.

 Nabízíme:
  • Zajímavé téma
  • Spolupráci v řešitelském kolektivu
  • Přátelskou atmosféru a dobré prostředí
 Očekáváme:
  • Tvůrčí zájem o řešené téma
  • Schopnost samostatné a precizní práce
  • Solidní znalost anglického jazyka pro studium odborného textu