Izotypové složení aktinu v rostlinné buňce a jeho význam |
Typ práce |
bakalářská - literární rešerše |
Školitel |
RNDr. Kateřina Schwarzerová, Ph.D.
Katedra fyziologie rostlin PřF UK, Viničná 5, Praha 2
kontakt: schwarze@natur.cuni.cz
tel: 22 195 1688
web: http://kfrserver.natur.cuni.cz/vyzkum/tymy/tym_opat/cytoskelet/index.htm
|
Konzultant |
Mgr. Lukáš Fischer, Ph.D.
Katedra fyziologie rostlin PřF UK, Viničná 5, Praha 2
kontakt: lukasf@natur.cuni.cz
tel: 22195 1688
web: http://kfrserver.natur.cuni.cz/vyzkum/tymy/tym_opat/molbio/index.htm
|
Náplň práce:
Cytoskelet představuje jednu z nejdůležitějších struktur eukaryotické buňky. Tyto proteinové vláknité struktury vznikají polymerací proteinových monomerů tubulinu (v případě mikrotubulů) a aktinu (v případě aktinových filament). Cytoskelet vykonává v živočišných i rostlinných buňkách množství funkcí. Tato mnohočetnost rolí je umožněna dynamikou cytoskeletu i jeho složením. Na funkcích cytoskeletu mají podstatný podíl například asociované proteiny, které regulují dynamiku cytoskeletálních polymerů, interakce mezi cytoskeletálními polymery (svazkování, zesíťování), či jejich interakce s okolními strukturami (organelami, proteinovými komplexy, membránami). Významnou roli ve vlastnostech výsledného cytoskeletálního polymeru však má i složení na úrovni monomerů. Aktiny i tubuliny jsou kódovány genovými rodinami, proto je v buňce syntetizováno vždy několik druhů aktinových a tubulinových monomerů – izotypů. Jednotlivé monomery jsou navíc dále posttranslačně upravovány, což je zdrojem další heterogenity monomerních podjednotek. V různých částech rostliny je pravděpodobně syntetizována vždy jen určitá skupina izotypů. Například aktiny rostliny Arabidopsis thaliana lze rozdělit do dvou skupin podle toho, zda jsou syntetizovány v generativních či vegetativních pletivech.
Cílem bakalářské práce je zpracovat formou literárního přehledu současný stav poznání o roli izotypového složení rostlinného aktinového cytoskeletu v životě rostliny. Přehled by měl zahrnout údaje o molekulární podstatě rozdílů mezi izotypy aktinu (rozdíly mezi geny genových rodin, informace o posttranslační modifikaci aktinů), poznatky o jejich expresi v rostlinné buňce, případně o regulaci exprese jednotlivých genů. Dále by měla být pozornost věnována informacím o roli rozdílných izotypů aktinu v různých rostlinných pletivech. Součástí literární rešerše by měl být též základní přehled o metodách, využívaných ke studiu aktinového cytoskeletu a jeho izotypového složení.
Na bakalářskou práci je možné navázat diplomovou prací „Role cytoskeletu v průběhu somatické embryogeneze smrku“.
Nabízíme:
- Zajímavé téma
- Spolupráci v řešitelském kolektivu
- Přátelskou atmosféru a dobré prostředí
Očekáváme:
- Tvůrčí zájem o řešené téma
- Schopnost samostatné a precizní práce
- Solidní znalost anglického jazyka pro studium odborného textu
|
|