Změny proteomu rostlin v průběhu biotransformace organických xenobiotik
 Typ práce bakalářská, diplomová, disertační
 Školitel RNDr. Radka Podlipná, Ph.D.
Laboratoř rostlinných biotechnologií ÚEB AVČR
kontakt: podlipna@ueb.cas.cz
tel: 233 022 213
 Anotace:

Naše skupina se již delší dobu zabývá vlivem organických xenobiotik (PAH, výbušniny, léčiva) na rostlinu, biotransformací a akumulací těchto látek v rostlinném organismu a možností využití těchto pochodů k moderním remediačním technologiím. Hledáme studenty, kteří by se s námi chtěli věnovat této problematice na úrovni proteomu.

Studovaná problematika:
  • Studium mechanismu degradace/akumulace vybraných xenobiotik
  • Identifikace degradačních produktů
  • Studium kinetiky degradace vybraných xenobiotik – nalezení časové závislosti exprese proteinů
  • Optimalizace metod pro studium stresové odpovědi rostlin na úrovni proteomu (metoda extrakce proteinů z rostlin, dvoudimenzionální elektroforéza, vizualizace proteinů)
  • Detekce stresových proteinů – porovnávání získaných map s dostupnými databázemi, v případě neshody (nalezení stresového proteinu) použití hmotové spektrometrie pro jeho identifikaci (MALDI-TOF)
  • Studium akumulace perzistentních organických látek v nadzemních částech rostlin s ohledem na možnost jejich vstupu do potravního řetězce konzumentů 1.řádu.
Téma (dle rozsahu) může být řešeno na úrovni bakalářské, diplomové i disertační práce.